為保障海峽兩岸人民權益，促進兩岸經濟、科技與文化發展，海峽兩岸關系協會與財團法人海峽交流基金會就兩岸知識產權（智慧財產權）保護合作事宜，經平等協商，達成協議如下：
一、合作目標
雙方同意本著平等互惠原則，加強專利、商標、著作權及植物新品種權（植物品種權）（以下簡稱品種權）等兩岸知識產權（智慧財產權）保護方面的交流與合作，協商解決相關問題,提升兩岸知識產權(智慧財產權)的創新、應用、管理及保護。
二、優先權利
雙方同意依各自規定，確認對方專利、商標及品種權第一次申請日的效力，并積極推動作出相應安排，保障兩岸人民的優先權權益。
三、保護品種
雙方同意在各自公告的植物品種保護名錄（植物種類）范圍內受理對方品種權的申請，并就擴大植物品種保護名錄（可申請品種權之植物種類）進行協商。
四、審查合作
雙方同意推動相互利用專利檢索與審查結果、品種權審查和測試等合作及協商。
五、業界合作
雙方同意促進兩岸專利、商標等業界合作，提供有效、便捷服務。